Добрый день, Николай.
Согласно п. 138.8 НК (налогообложение прибыли — раздел ІІІ) амортизация относится в состав себестоимости произведененных товаров (работ, услуг), а себестоимость относится к расходам. Поскольку п. 177.4 НК, регламентирующий расходы ФОПа отсылает к соответствующим нормам по налогообложению прибыли, то можно пользоваться п. 138.8 и относить аммортизацию в состав расходов.
Обратите внимание на абз. 2 п. 177.4 НК!
«Не належить до витрат фізичної особи — підприємця вартість придбаного рухомого і нерухомого майна, що підлягає державній реєстрації, у разі якщо таке майно придбано до державної реєстрації фізичної особи — суб'єктом підприємницької діяльності та/або не використовується в такій діяльності».

С уважением, Виталий Рябов.