Нет, запрета нет.
Имеется в виду, что лица, работающие бухгалтерами, адвокатами и т.д. по найму (трудовому договору), не являются «осуществляющими независимую профессиональную деятельность».
Но при этом, работая по найму, Вы можете кроме этого осуществлять другую предпринимательскую деятельность, и в части этой деятельности будете считаться «самозанятым лицом».