Ирина, здравствуйте!

Вы уже сами ответили на первый вопрос «по частям»! То есть, у нотариуса заключить сделку купли-продажи 1/2 части дома в один день, на другой день — на следующую 1/2 часть.
НДФЛ будет составлять 0%, так как на унаследованное недвижимое имущество норма закона относительно 3-х лет не распространяется.
Нужно оплатить:
1% — госпошлина (продавец);
1% — ПФ (покупатель);
за регистрацию в Реестре вещных прав 119 грн. (госпошлина)+ 120 грн. (выписка);
за услуги нотариуса, если заключать сделку будете у частного нотариуса (сумма оговаривается по договоренности).
Относительно возможных льгот — оговаривайте с нотариусом.