Здравствуйте, Игорь!

На данном этапе, вы не можете на себя и отца оформить свидетельство на право собственности, поскольку документ на землю оформлен на брата и Декларация о вводе в эксплуатацию тоже. Тем более, отсутствуют документы, которые подтверждали бы ваше участие в инвестировании данного строительства. Можно конечно, попробовать подать в Государственную регистрационную службу для оформления свидетельства на право собственности, нотариальное заявление от вас троих о том, что строительство вы осуществляли вместе. Также данным заявлением определить доли каждого из вас. Но не гарантирую, что регистратор лишь на основании такого нотариального заявления оформит свидетельство на вас с отцом.
Поэтому в данном случаи, нужно оформить свидетельство на право собственности на брата, а потом с помощью нотариального договора (купля-продажа, дарение) переоформить дом и землю на вас.
После этого можете заключать договор о разделе недвижимого имущества в натуре (у нотариуса) на основании заключения техника или инженера о возможном техническом разделе такого недвижимого имущества на отдельные квартиры.