Юнекс Банк є учасником Фонду гарантування вкладів фізичних осіб. Свідоцтво учасника фонду гарантування вкладів фізичних осіб №152 від 05 листопада 2002 р. Розмір гарантованої суми відшкодування за вкладами, включаючи відсотки, складає 200 000 грн.