Соответствующее постановление правительства № 323 от 28 апреля 2010 года опубликовано на веб-сайте Кабмина.
Госцентр создан предыдущим Кабинетом министров Украины под руководством Юлии Тимошенко на базе Межведомственного научно-экспериментального центра по изучению инфекционных болезней общих для людей и животных, Института ветеринарной медицины Украинской академии аграрных наук.
Организация напрямую подчинялась правительству Украины.